【5】基于组装基因组鉴定结构变异–MUMandCo

文章地址：https://academic.oup.com/bioinformatics/article/36/10/3242/5756209 Github地址：https://github.com/SAMtoBAM/MUMandCo​​​​​​
博客参考： MUMandCo软件的使用 - 简书
软件下载安装：
git clone https://github.com/SAMtoBAM/MUMandCo.git
NOTE: 软件是用shell语言写的，没有封装也不需要安装，可以直接使用。
先用自带的数据进行测试（yeast_DEL100_test目录下）：
bash mumandco_v3.7.sh -r ./yeast.tidy.fa -q ./yeast_tidy_DEL100.fa -g 12500000 -o DEL100_test
NOTE: 一定要用bash，用sh会出错。
全部参数如下： 
-r or --reference_genome path to reference genome
-q

【5】基于组装基因组鉴定结构变异–MUMandCo最先出现在Python成神之路。