基因家族分析 | Pfam 2024年最新搜索方法

目前这个pfam还能用，但只是一个搜索网站了。

http://pfam.xfam.org/

pfam页面

注意到最上面，现在只能在interpro找到我们想要的hmm文件。

当然，我们仍然可以用这个页面搜索，只是结果会跳转到InterPro。

一般老师会给我们一个想要分析的家族基因的名字，以我的为例子：galactosyltransferase

我们先在 KEYWORD SEARCH 填上我们要搜索的家族名

KEYWORD SEARCH

点击GO，我们会进入InterPro的页面。我们会发现很多结果，但我们要注意数据库来源，要选PFAM的结果来获取hmm文件。

找PFAM

根据你们自己的需求看对应的描述，点击PF号码或者家族名都可以进入。

Curation

点击Curation这里就是我们下载hmm文件的地方。