【关于微阵列芯片和RNA-seq的比较】

关于微阵列芯片和RNA-seq的比较
转录组代表存在于细胞中RNA的全部类型，包括mRNA、rRNA、tRNA以及其它各种非编码RNA等。转录组是了解细胞过程的主要手段，微阵列（Microarray）和RNA-seq（RNA sequencing）是转录组分析中的两种主要技术。它们的主要区别在于，微阵列基于预先设计的标记探针与目标cDNA序列的杂交，而RNA-seq通过测序技术对cDNA链进行直接测序。
微阵列
微阵列取决于杂交探针，根据杂交信号强度定量基因相对表达水平。
首先从样品中提取总RNA，然后构建cDNA文库。将cDNA与预先设计的带荧光标记的DNA探针在固体表面（spot matrix）混合，互补序列将与微阵列中的标记探针杂交。通过检测微阵列的探针荧光强度，这些探针代表了不同的基因，可获得各基因的相对表达谱。
一般而言，微阵列探针的荧光强度应与样品中互补cDNA（代表转录物）的丰度成正比。但

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