GBS技术简介

GBS技术简介： GBS（Genotyping-by-Sequencing）技术指通过测序进行基因分型，通过选取合适的限制性内切酶结合高通量群体测序构建SNP分子标记，可用于分子标记开发、超高密度遗传图谱构建、群体遗传分析、群体GWAS分析等。

基于测序技术构建的Bin图谱与传统遗传图谱相比，不仅标记密度更高，能够提供准确的物理位置，而且能够精确检测双交换事件，使QTL定位更准确，区间更小。使得直接从定位区间筛选候选基因成为可能。

已有研究表明，QTL的紧密连锁或者成簇分布可能是水稻叶绿素含量的遗传基础之一。当LOD值超过阈值的一段区域内存在多个峰值时，通过传统遗传图谱很难区分开，往往导致效应较小的位点被遮盖[23]。本研究在位置相邻的区域定位到了控制剑叶叶绿素含量的多个QTL。Bin图谱进行QTL检测可将位置非常临近的QTL有效地分离开来，测序分型得到的大量SNP标记还可以快速应用于分子育种，在水稻复杂性状的定位、候选基因鉴定和标记辅助选择方面具有非常大的应用前景。（参考文献：赵凌, 张勇, 魏晓东等. 利用高密度Bin图谱定位水稻抽穗期剑叶叶绿素含量QTL[J]. 中国农业科学, 2022, 第55卷(5):825-836.）

genotyping-by-sequencing高引用文章

1. Elshire R J, Glaubitz J C, Sun Q, et al. A robust, simple genotyping-by-sequencing (GBS) approach for high diversity species[J]. PloS one, 2011, 6(5): e19379. 

2.Development of High-Density Genetic Maps for Barley and Wheat Using a Novel Two-Enzyme Genotyping-by-Sequencing Approach 

3.Genomic Selection in Wheat Breeding using Genotyping-by-Sequencing

4.Genotyping-by-Sequencing for Plant Breeding and Genetics 

5. Bridging the genotyping gap: using genotyping by sequencing (GBS) to add high-density SNP markers and new value to traditional bi-parental mapping and breeding populations

6.Genotyping-by-sequencing (GBS), an ultimate marker-assisted selection (MAS) tool to accelerate plant breeding