表达谱芯片原理

一、Agilent芯片生产原理
参考:《陈巍学基因》笔记(29)Agilent生物芯片原理
Agilent芯片的基片是一个玻璃片。它的大小和一张标准的病理载玻片一样大小。
它的芯片制作过程,是用和喷墨打印一样的技术来进行制作的。喷墨打印机,是在墨盒里面是装了“红、黄、蓝、黑”四种颜色的墨水。而Agilent打印生物芯片的墨盒里面,是用带保护基团的A/C/G/T四种碱基底物,来代替了颜色墨水。分别含有4种碱基底物的小液滴,被按照设计的探针序列,依次、层叠地喷到玻璃板的确定的位置上。

在每一个碱基的延伸过程当中都有 3 个步骤,分别是偶联、氧化、 去除保护基团, 即先把一个核苷酸喷到玻璃板上,然后再喷上第二个碱基,让两个碱基之间发生偶联,继而 经过氧化,把亚磷酸基团氧化成磷酸基团。然后,把连在第二个碱基 5’ 位羟基上的 DMT 保 护基团去掉, 留下一个自由的 5’ 位羟基,再进行下一步的延伸反应。不断重复这个过程, DNA 链就会不断地延长。Agilent 的这个 DNA 链合成技术,每一步的合成效率都非常高,可 以达到 99%以上

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作者:lichengxin
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