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测序数据质量评估
1.覆盖深度 mapping depth 基因组被测序片段(短读 short reads)“覆盖”的强度有多大?每一碱基的覆盖率是基因组碱基被测序的平均次数。 基因组的覆盖深度是…… -
Easypoint(易点)单木结构参数快速提取
前言 我国传统的森林调查方式主要依靠人工样地调查,但这种方式通常存在耗时长、成本高、工作强度大等缺点,且在人力资源成本不断上升的未来难以持续适用。此…… -
数据库分享 | 从人类和小鼠组织在正常状态和疾病状态下的单细胞RNA测序中构建的细胞-细胞通讯网络图
Basic Information 英文标题: CellCommuNet: an atlas of cell–cell communication networks from single-cell RNA sequencing of human and mouse t…… -
数据系统可视化大屏与数字看板:赋能智慧未来的多面手
随着信息技术的飞速发展,数据已成为现代社会的重要驱动力。数据系统可视化大屏与数字看板作为数据呈现的前沿技术,正逐步渗透到智慧城市、乡村、社区、工厂、…… -
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全外显子组测序(WES)分析3: 变异功能注释(SnpEff / VEP )
1. 使用注释 VCF 文件 1.1 下载和安装 SnpEff # 下载 SnpEff $ wget http://sourceforge.net/projects/snpeff/files/snpEff_latest_core.zip # 解压 $ unzip …… -
近期发现,网络犯罪分子利用谷歌广告平台,向Mac用户推送含有信息窃取恶意软件的广告
近来有发现,一种专偷密码、加密货币钱包及其他敏感信息的Mac恶意软件,正通过谷歌广告四处流窜,这已经是近几个月来第二次出现这种滥用广受欢迎的广告…… -
批量下载TCGA所有数据
这是UCSC xena 页面 https://xenabrowser.net/datapages/ image.png cat cancer.ID | while read id; do echo $id mkdir -p $id cd $id wget -c htt…… -
TEtranscripts安装及使用大全(202406)
本文主要介绍TEtranscripts,常用于转座子研究。 官网:https://github.com/mhammell-laboratory/TEtranscripts/ Jin Y, Tam OH, Paniagua E, Hammell M. (20…… -
《高斯投影与转换V2.0》正算反算跨带换带计算投影带转换新型软件主要功能介绍
摘要 本软件为3度带和6度带高斯投影正反算及其二者的互相转换计算,还可以通过给出“带号增量”实现左右邻带换带计算和跨带换带计算。本软件智能化程度高,需要……