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Keymap: caps绑定ctrl、tab配合移动、esc自动切换输入法中英文
痛点 经常使用vim,喜欢用hjkl进行移动操作。ctrl不容易按到,所以绑定到不常使用的大小写锁定键。 在使用笔记和编程软件如 obsidian 和 vscode时配置了vim的…… -
MCMCtree计算分化时间
目前我知道的可以做物种分化时间计算的软件主要有beast,beast2,r8s,paml的mcmctree,还有Nagy论文中的PhyloBayes (R package)。目前呢,我是尝试使用了bea…… -
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R语言分析5:TMB分型
肿瘤突变负荷(Tumor Mutational Burden, TMB),指肿瘤细胞基因组中,基因的外显子编码区每兆碱基中发生置换和插入或缺失突变的总数。从理论上来说,高TMB(…… -
群体遗传研究——变异注释–snpEff和ANNOVAR
snpEff snpEff4.0软件之后默认下载安装所有动物的库(ensembl的库) 查询对应物种的数据库 java -jar /home/sll/software/snpEff/snpEff.jar databases | gre…… -
参考基因组详解
探序基因肿瘤研究院 整理 Ensembl网站: https://asia.ensembl.org/index.html 下载参考基因组: 人:http://ftp.ensembl.org/pub/current_fasta/homo_sapie…… -
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好用的工具整理
Windows版: 1.屏幕录制软件:ApowerREC 2.Windows端视频播放器:Potplayer 3.抓包工具:charles 4.邮箱客户端:foxmail 5.vpn软件:EasyConnect(深信服)、Hi…… -
全基因组 – 人类基因组变异分析(PacBio) (3)– pbmm2
一. 长读段比对 (Long-Read Mapping)常用的比对软件 长读段比对算法与一代/二代测序数据的比对算法有很大的不同,因为长读段通常更长、包含更多错误和变异,并……