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包含标签:GitHub 的文章
  • GTDB基因组分类数据库及GTDB-Tk工具
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    GTDB基因组分类数据库及GTDB-Tk工具

    Introduction GTDB(Genome Taxonomy Database)是一个专注于基因组分类学的数据库,旨在提供高质量的细菌、古细菌、叶绿体和线粒体的分类信息。通过使用全基……
    cc 2024-05-25
  • 常见的Markdown在线编辑器
    杂文

    常见的Markdown在线编辑器

    Markdown是一种流行的轻量级标记语言,许多人喜欢用它来撰写文档或发布网页内容。许多人选择使用Markdown编写文章。 在Win/Linux系统中有几个适用的Markdown……
    cc 2024-05-24
  • 基因组共线用Mauve
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    基因组共线用Mauve

    文献信息 标题:Mauve: multiple alignment of conserved genomic sequence with rearrangements 中文:保守基因组序列重排多重比对 杂志:GENOME RESEARCH 时……
    Zad 2024-05-24
  • JRT 相关项目迎来重大更新!
    杂文

    JRT 相关项目迎来重大更新!

    简书消零派辅助工具升级 半年前,作为 JRT 发布后的项目示例,恰逢消零派兴起之际,我们发布了消零派辅助工具(文章链接 在这里)。 意料之中的,该项目在社区……
    Mr李 2024-05-21
  • 使用BiG-SCAPE挖掘微生物组BGCs
    杂文

    使用BiG-SCAPE挖掘微生物组BGCs

    Introduction 在生物信息学领域,对(宏)基因组进行生物合成基因簇(BGCs)的挖掘,编码次生代谢产物的生产已成为自然产物发现的关键策略。在单个基因组水平……
    倾城 2024-05-20
  • 上传测序数据至ENA数据库
    杂文

    上传测序数据至ENA数据库

    Introduction European Nucleotide Archive (ENA) 是一个由欧洲分子生物学实验室 (EMBL) 欧洲生物信息学研究所 (EBI) 维护的公共数据库。ENA 收集、存储和提供……
    玉兰 2024-05-20
  • 序列比对软件 MUMmer 结果可读化处理(四)
    杂文

    序列比对软件 MUMmer 结果可读化处理(四)

    关于该软件的计算可选参数以及结果文件的解读,见前三篇分享: 序列比对软件 MUMmer 快速上手(一) 序列比对软件 MUMmer 高级使用(二) 序列比对软件 MUMmer……
    倾城 2024-05-20
  • 常用扩增子数据库
    杂文

    常用扩增子数据库

    Introduction 扩增子测序是一种主要用于研究微生物群落结构的分子生物学技术。它主要用于分析环境样本中的微生物群落,特别是对细菌和古菌的16S rRNA基因以及……
    Mr李 2024-05-20
  • 各大插件市场智能助手评分榜出炉!百度Comate稳居第一
    杂文

    各大插件市场智能助手评分榜出炉!百度Comate稳居第一

    近日,在VSCode、Jetbrains等各大插件市场智能助手评分榜中,百度Comate分别以4.5和4.4位列第一,通义灵码位居第二、第三,CodeGeeX、iFlyCode、aiXcoder、Gi……
    congcong 2024-05-17
  • Li’s Bioinfo-Blog 的有用的几个包
    杂文

    Li’s Bioinfo-Blog 的有用的几个包

    https://lishensuo.github.io/ 单细胞分析工具--scCustomize包改进Seurat可视化 https://lishensuo.github.io/posts/bioinfo/033%E5%8D%95%E7%BB%86%E8%83%9E%……
    玉兰 2024-05-16