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包含标签:GitHub 的文章
  • 扩增子分析:qiime2平台全流程分析
    杂文

    扩增子分析:qiime2平台全流程分析

    Amplicon sequencing analysis pipeline through qiime2 platform qiime2是扩增子数据分析的最佳平台之一,其提供了大量从原始data到统计分析的插件,尤其是它……
    Alex 2024-06-11
  • 数据分析:基于DESeq2结果的基因富集分析
    杂文

    数据分析:基于DESeq2结果的基因富集分析

    介绍 DESeq2常用于识别差异基因,它主要使用了标准化因子标准化数据,再根据广义线性模型判别组间差异(组间残差是否显著判断)。在获取差异基因结果后,我们……
    Zad 2024-06-08
  • Call种内微生物SNP用Parsnp
    杂文

    Call种内微生物SNP用Parsnp

    parsnp可进行核心基因组对齐、call核心基因组SNP、构建SNP进化树。 Github: https://github.com/marbl/parsnp Manual: https://harvest.readthedocs.io/en/l……
    Alex 2024-06-03
  • 区块链全栈以太坊(十二)nft学习之静态NFT、动态NFT
    杂文

    区块链全栈以太坊(十二)nft学习之静态NFT、动态NFT

    一、简介 ERC-721 以太坊创建的一个令牌标准。 NFT 代表不可替换的令牌,类似如 ERC20是可替换的令牌。 还有一个半可替换标准 ERC1155 NFT 平台 openSea w……
    dingding 2024-06-01
  • 程序员如何掌控自己的运气
    杂文

    程序员如何掌控自己的运气

    运气这个字眼在许多情境下都被提及,总是和某种不可预测的好运挂钩——但在争取成功的道路上,特别是在程序员的世界里,我们如何捉住所谓的“运气”,将其转变为我……
    Zad 2024-05-31
  • 空间单细胞图谱揭示脊椎动物咽部器官的演化起源
    杂文

    空间单细胞图谱揭示脊椎动物咽部器官的演化起源

    作者,Evil Genius 最近真是见鬼了,不是让我关了B站视频,就是举报我的文章,都闲的没事干是么? 昨晚太原又跳桥了,那些有功夫举报我的人,你要是还能说一句……
    siwei 2024-05-30
  • 如何获取质粒上的特征元件
    杂文

    如何获取质粒上的特征元件

    在使用SnapGene进行质粒构建、引物设计、片段扩增时候,你是不是也遇到如下令人头疼的问题: 序列导入SnapGene后,软件自动识别的元件Common Features有限,……
    lichengxin 2024-05-30
  • 宏基因组分析流程(Metagenomic workflow)202405|持续更新
    杂文

    宏基因组分析流程(Metagenomic workflow)202405|持续更新

    Logs 增加R包pctax内的一些帮助上游分析的小脚本(2024.03.03) 增加Mmseqs2用于去冗余,基因聚类的速度非常快,且随序列量线性增长(2024.03.12) 更新全文……
    ht 2024-05-29
  • 单细胞分析(Signac): PBMC scATAC-seq 整合
    杂文

    单细胞分析(Signac): PBMC scATAC-seq 整合

    引言 在本教学指南中,我们将探讨由10x Genomics公司提供的人类外周血单核细胞(PBMCs)的单细胞ATAC-seq数据集。 加载包 首先加载 Signac、Seurat 和我们将用……
    Mr李 2024-05-29
  • 外显子数据分析之基因融合factora
    杂文

    外显子数据分析之基因融合factora

    作者,Evil Genius~~~ 美国人不按照套路出牌啊,外显子CNV分析原理及各种注意事项刚给下面的人培训完,结果今天考核的基因融合,真是出事了。 让我想起了刚入……
    congcong 2024-05-28