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扩增子分析:qiime2平台全流程分析
Amplicon sequencing analysis pipeline through qiime2 platform qiime2是扩增子数据分析的最佳平台之一,其提供了大量从原始data到统计分析的插件,尤其是它…… -
数据分析:基于DESeq2结果的基因富集分析
介绍 DESeq2常用于识别差异基因,它主要使用了标准化因子标准化数据,再根据广义线性模型判别组间差异(组间残差是否显著判断)。在获取差异基因结果后,我们…… -
Call种内微生物SNP用Parsnp
parsnp可进行核心基因组对齐、call核心基因组SNP、构建SNP进化树。 Github: https://github.com/marbl/parsnp Manual: https://harvest.readthedocs.io/en/l…… -
区块链全栈以太坊(十二)nft学习之静态NFT、动态NFT
一、简介 ERC-721 以太坊创建的一个令牌标准。 NFT 代表不可替换的令牌,类似如 ERC20是可替换的令牌。 还有一个半可替换标准 ERC1155 NFT 平台 openSea w…… -
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空间单细胞图谱揭示脊椎动物咽部器官的演化起源
作者,Evil Genius 最近真是见鬼了,不是让我关了B站视频,就是举报我的文章,都闲的没事干是么? 昨晚太原又跳桥了,那些有功夫举报我的人,你要是还能说一句…… -
如何获取质粒上的特征元件
在使用SnapGene进行质粒构建、引物设计、片段扩增时候,你是不是也遇到如下令人头疼的问题: 序列导入SnapGene后,软件自动识别的元件Common Features有限,…… -
宏基因组分析流程(Metagenomic workflow)202405|持续更新
Logs 增加R包pctax内的一些帮助上游分析的小脚本(2024.03.03) 增加Mmseqs2用于去冗余,基因聚类的速度非常快,且随序列量线性增长(2024.03.12) 更新全文…… -
单细胞分析(Signac): PBMC scATAC-seq 整合
引言 在本教学指南中,我们将探讨由10x Genomics公司提供的人类外周血单核细胞(PBMCs)的单细胞ATAC-seq数据集。 加载包 首先加载 Signac、Seurat 和我们将用…… -
外显子数据分析之基因融合factora
作者,Evil Genius~~~ 美国人不按照套路出牌啊,外显子CNV分析原理及各种注意事项刚给下面的人培训完,结果今天考核的基因融合,真是出事了。 让我想起了刚入……