登录计算节点，激活环境

salloc -p tyhctest -N 1 -n 2
ssh 计算节点
source ./miniconda3/bin/activate
conda activate celescope
logout#或者Ctrl + D

使用方法

celescope rna mkref /
--genome_name /#设置参考基因组的名称，这个名称会最终展示到celescope生成的报告里，默认为None
--fasta /#接fasta文件
--gtf /#接gtf文件

实列
提交任务

source ./miniconda3/bin/activate
conda activate celescope
celescope rna mkref /
--genome_name Rat/
--fasta Rattus_norvegicus.mRatBN7.2.dna.toplevel.fa/
--gtf Rattus_norvegicus.mRatBN7.2.109.gtf /

参考资料：

GEXSCOPE®单细胞(核)转录组数据分析-新格元生物科技 (singleronbio.com)