rMATs 分析可变剪切

rMATs 可变剪切及rmats2sashimiplot可视化安装与使用
一、安装及使用
用conda安装：
conda install -c bioconda rmats=4.0.2 （要用4.0.2的版本做，才可以跑出结果）
检查是否安装上：rmats.py -h
如果出现帮助文档，即可运行使用

（1）将bam文件传输到b1.txt和b2.txt中（传输时，各个bam文件之间用逗号隔开，但不能放空格，用英文逗号，bam文件需要用到hisat2 比对出来的，只能用bam文件可以出结果）
echo 231ESRP.25K.rep-1.bam,231ESRP.25K.rep-2.bam > b1.txt
echo 231EV.25K.rep-1.bam,231EV.25K.rep-2.bam > b2.txt

（2）用rmats软件运行跑结果
rmats.py --b1 b

rMATs 分析可变剪切最先出现在Python成神之路。