如何简单快捷的进行单细胞分析

最近一段时间正在努力学习单细胞相关的理论知识，发现单细胞测序和普通的真核细胞的转录组非常相似。两者之间的最大的区别在于，一个测的是单个细胞的表达，一个测的是一堆细胞的表达之和。所以从这里就可以理解，为什么网上很多教程都在说，单细胞数据是一个巨大的稀疏矩阵。假设，一个样本可以捕获一万个细胞，这时候单细胞的矩阵大小为：2w个基因*样本数*1万个细胞，而转录组数据的大小：2w个基因*样本数。两个矩阵相差了一万倍，巨大一词就是从此处而来。

我们要理解不是所有的细胞都要表达2w个基因，细胞在机体内有各自的分工，所以有的细胞可能就只表达了几百个基因，有的是几十个，有的是几千个，所以单细胞数据中会存在大量的零，这种数据又被称为稀疏矩阵。

那我们怎么做单细胞分析呢？

目前生信豆芽菜推出了一个单细胞工具分析。老版的如下：

http://www.sxdyc.com/singleCellTool

该版本的使用，需要对单细胞工具分析流程有一定的了解才可以。但是目前使用工具进行分析的小伙伴其实很多和我应该是一样的，没什么基础。甚至第一步做什么，第二步做什么都不了解。

为此，通过和小白老师沟通，终于想出来了一个针对新手分析单细胞数据的方式，就是目前新版的单细胞分析

http://www.sxdyc.com/singleCellBasicVisual

详细的过程可以看小白老师的教程：https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkxMjMxOTcyNQ==&mid=2247488386&idx=1&sn=99ef70cbfb5c16578b4b71e946a7a344&chksm=c10fe600f6786f16c76c29d6f8dd059b5d56a34a483429f95f01cf1a934fbc72b9d28ab3c6b5&token=886905049&lang=zh_CN#rd

并附带了视频讲解：哔哩哔哩链接：https://www.bilibili.com/video/BV1Ft421g7y4/?spm_id_from=333.999.0.0&vd_source=a88031824b3f734795656d5934ac4c66