微管蛋白ε和δ复合物2(TEDC2)在人类肿瘤中的预后意义和致癌作用的全癌分析

简介:微管蛋白ε和δ复合物2(TEDC2)在各种人体组织中广泛表达,主要控制中心粒的稳定性。然而,TEDC2在泛癌中的生物学意义尚不清楚。

方法:在本研究中,我们使用R软件和各种在线生物信息学分析工具来研究TEDC2在人类肿瘤中的功能属性及其在免疫反应中的潜在作用。在来自TCGA和GEO数据集的样本以及来自TCGA数据库的肿瘤和相应的正常样本中评估TEDC2表达的状态。随后,使用Kaplan-Meier估计、临床相关性和单变量Cox回归分析TCGA的33种肿瘤类型,并确定TEDC2的预后意义。此外,使用三种不同的肿瘤,即肾肾透明细胞癌(KIRC)、肺腺癌(LUAD)和肝细胞癌(LIHC),建立列线图模型,以评估TEDC2在肿瘤中的预后意义。此外,研究了TEDC2与免疫细胞浸润水平的相关性,并进行了功能富集分析,以确定涉及TEDC2的潜在信号通路。

结果:差异分析显示,16种肿瘤类型的TEDC2表达程度高于正常组织。TEDC2的异常表达可以预测肾上腺皮质癌(ACC)、肾乳头状细胞癌(KIRP)、LUAD、LIHC、低级别胶质瘤(LGG)和胸腺瘤(THYM)患者的生存结果。随后的结果表明,TEDC2具有影响ECM调节因子、细胞周期和免疫检查点相关信号通路的能力,这可能导致不良预后和肿瘤进展。

讨论:TEDC2已被确定为一种潜在的治疗靶点,可以预测多种肿瘤类型的预后,使其成为逆转肿瘤发展的有希望的靶点。

文中RNA转染采用Entranster-R4000转染试剂来实现。

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作者:感冒的梵高
链接:https://www.techfm.club/p/129362.html
来源:TechFM
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