论文数据
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一、PBMC
1、炎症
人类肝硬化的纤维化- GEO Accession viewerGSE136103 NAFLD 4个PBMC
新冠整体一个数据 - GEO Accession viewerGSE158055
败血症 - GEO Accession viewerGSE167363 10个脓毒症 2个对照
流感和新冠- GEO Accession viewerGSE149689 5个流感 4个对照 11个新冠 数据合在一起的
白塞病 - GEO Accession viewerGSE198616 8个白塞病,8个对照。还有PBMC转录组
系统性红斑狼疮 SLE - GSE135779 8 adult SLE (aSLE) patients and 6 个对照 (aHD)。剩下的是小孩数据
多发性硬化症MS - GSE138266 5个MS,没有对照
原发性干燥综合征 (pSS)- GSE157278 5个样本,5个对照,10个样本才5W细胞,19年测的数据
系统性硬化症(SSc)
新冠伴有肺纤维化 - GSE165182 3个中等严重,12个重症,4个对照。
特发性肺纤维化 (IPF) - 单细胞分析揭示进行性特发性肺纤维化中的免疫畸变 - PubMed 文章下载不了
乙肝 - GSE182159 17个肝炎,6个健康,PBMC和肝组织匹配。PBMC是全部,肝组织是CD45+
肝纤维化 NAFLD -GSE136103 5个纤维化肝组织,5个正常肝组织。4个PBMC
疟疾 - GSE217930 3个成年人的感染第0天,2个对照(20多岁的年轻人)
2、肿瘤
胰腺导管腺癌(PDA)- GEO Accession viewer 17个肿瘤 4个对照
胆管癌的 5 名患者,所有患者在肿瘤切除前均未接受过任何术前治疗(化疗、放疗或抗肿瘤药物)。- GEO Accession viewer 5个PBMC
胰腺癌 - GEO Accession viewer 17个PBMC 4个对照
肾癌 GSE121636 肾癌和PBMC的CD45+ ,3个PBMC
3、对照
二、肝脏
人类肝硬化的纤维化- GEO Accession viewer CD45-
三、肺
有用的文章-单核细胞相关
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类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮和原发性干燥综合征外周血中巨核细胞均扩张 - PMC与健康对照相比,这些 AD 具有相似的转录谱,共享差异表达基因 ((DEG)
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三、肠道
溃疡性结肠炎 - GEO Accession viewer 有PBMC,但是是CD45+的
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