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影响因子:8.2
研究概述:肺腺癌(LUAD)是非小细胞肺癌最常见的组织学亚型。目前,LUAD的诊断主要依靠病理分析和图像诊断,但存在材料获取困难、且具有侵入性等局限。血清作为临床上最常用的测试样本,具有侵入性小、易于获取和可重复的优点。适用于LUAD的诊断治疗。但是,血清标志物的敏感性和特异性还不够可靠。因此,发现有效的血清生物标志物将有助于LUAD的诊断和治疗。脂质运载蛋白2(LCN2),是一种分泌型糖蛋白,存在于多种组织和细胞类型中,在许多生理和病理过程中起介质作用。所以,作者对LCN2在LUAD中的作用进行了研究。作者基于生物信息学算法对LCN2表达与LUAD临床特征和预后的相关性进行了分析。并通过共表达基因的富集分析探究了其潜在的分子机制。并且,作者通过免疫浸润分析对LCN2在肿瘤微环境(TME)中的作用进行了阐述。并通过体外实验验证了LCN2的促癌作用。最后,作者通过进一步的临床样本分析证明了LCN2作为LUAD生物标志物的重要意义。最终证明,LCN2 作为一种致癌糖蛋白促进与免疫浸润相关的癌症进展,并且可能是 LUAD 的潜在诊断和预后标志物。
研究结果:
LUAD的LCN2在各数据库的表达
已有研究证明,LCN2在肿瘤中即可能是促癌因子也可能是抑癌因子。为了获得LCN2的表达情况,作者首先通过TIMER数据库对LCN2在33种癌症中的的表达情况进行研究。如图1A所示,与正常组织相比,胆管癌、肺腺癌、结肠癌、食管癌、肾状细胞、肝脏、直肠癌、甲状腺肿瘤和子宫内膜样肿瘤的LCN2表达上调。随后,作者在TCGA数据库中验证了LUAD的LCN2 基因表达情况。结果显示,与正常组织相比,LCN2在LUAD中上调(如图1B,C)。最后,作者通过HPA数据库获得LCN2的免疫组化(IHC)结果。与前两步结果一致,LUAD中的LCN2蛋白水平显著上调(如图1D)。这些结果表明,LCN2在LUAD中可能促进肿瘤的发生。
TCGA数据库中LCN2表达与LUAD临床特征的相关性
作者基于TCGA数据库对LCN2表达与临床特征的相关性进行了分析,以探索LCN2表达可能受哪些临床因素的影响。结果显示,LCN2在III-IV期、T3-T4期、N1-N3和M1期的表达水平明显更高(如图2)。随后,作者通过多因素logistic回归对LCN2的表达情况的影响因素进行研究。结果表明,LCN2高表达与淋巴结转移相关(如表1)。
LCN2表达与LUAD预后的相关性
作者通过Kaplan-Meier数据库对患者的总生存期(OS)和无疾病生存期(DFS)与LCN2表达水平的进行了相关性分析。结果显示,LCN2高表达,NSCLC患者的OS(如图3A)和DFS(如图3D)短,LUAD的OS(如图3B)和DFS(如图3E)也更短。然而,LCN2 表达与 LUSC 存活率之间没有相关性(如图3C和F)。作者又通过多因素COX回归分析发现,N型LUAD患者和LCN2高表达是LUAD患者独立预后危险因素(如图4A)。除此之外,作者进一步构建了基于两个危险因素的预后列线图(如图4B)。TimeROC 和 Calibration 曲线显示,预后模型在预测 LUAD 的 1 年、3 年和 5 年生存率方面具有良好的区分度和一致性(如图5A和5B)。此外,作者基于GSE68465队列进行了外部验证。结果与上述一致,证明了预后模型的良好疗效(如图5C和5D)。这表明,LCN2具有成为LUAD预后标志物的潜力,且LCN2高表达时,患者预后差。
LCN2共表达基因的功能富集分析
为了找到LCN2在LUAD发病机制中的下游靶点,作者通过对LCN2共表达基因和蛋白质的功能富集分析进行了探究,作者进行了如下分析。首先,作者通过Linkedomics数据库的功能模块获得了LUAD患者的LCN2共表达基因。其前50个与LCN2呈正相关和负相关的基因通过热图展示在图6A和6B中。随后,作者对LCN2以及其共表达基因进行GO和KEGG富集分析以展示其参与的生物过程。分析表明,上述基因主要位于核膜和细胞膜上,LCN2可能会影响细胞内信号转导,主要参与丝氨酸/苏氨酸激酶信号通路(如图6C-E)。KEGG富集分析显示,上述基因主要富集于TNF信号通路(如图6F)。作者将LCN2与其相关的前10个共表达基因的相关性分析展示于图7A-J。上述结果表明,LCN2的肿瘤促进作用可能与JAK-STAT、TNF、NF-κB、HIF-1和PI3K-Akt信号通路有关。
LCN2表达与肿瘤浸润免疫细胞的关系
LCN2作为一种先天免疫蛋白,在TME中被认为是一种致癌免疫蛋白,所以作者对于LCN2在TME中的作用进行了探究。为了对LCN2在肿瘤免疫中的作用进行研究,作者基于TCGA中LUAD队列对LCN2高表达和低表达的之间免疫细胞的浸润水平进行差异表达(图8)。结果显示,在LCN2高表达组中CD8 T细胞、T细胞滤泡辅助细胞、T 调节细胞、巨噬细胞 M1 、中性粒细胞的浸润水平更高;而Tγ δ、巨噬细胞M2、休眠肥大细胞、嗜酸性粒细胞在LCN2低表达组中浸润水平更高。其他TIICs没有显示出统计学上的组间差异。
敲低LCN2后,细胞增殖、迁移和侵袭能力受到抑制
前文发现,LCN2可能会通过PI3K-Akt信号通路促进肿瘤细胞的增殖和侵袭,又有研究发现,LCN2是参与细胞增殖、迁移和侵袭的核心基因。所以,作者对LCN2在LUAD细胞增殖、迁移和侵袭的过程中发挥的作用进行了研究。首先,作者验证了LCN2在 LUAD 细胞系中在转录组和蛋白质组表达水平上的变化。PC9和H1975中LCN2 基因(如图9A)和蛋白(如图9B)的表达均显著高于BEAS-2B。随后,作者使用siRNA载体敲低了LUAD细胞系中的LCN2。与阴性对照相比,LUAD细胞系PC9(如图9C-D)和H1975(如图9E-F)中的LCN2基因和蛋白表达显著降低。
作者通过CCK-8实验检测LCN2对LUAD细胞系增殖能力的影响。检测结果表明,LCN2敲低72 h后,PC9(如图10A)和 H1975(如图10B)的增殖能力明显受到抑制。接下来,作者采用愈合试验检测LCN2敲低对细胞迁移能力的影响。如图10C-D所示,与阴性对照相比,敲除LCN2后细胞迁移速率显著降低。此外,Transwell试验表明,LCN2敲低后,LUAD细胞的侵袭能力显著减弱(如图10E)。上述研究结果表明:LCN2促进LUAD的发生,属于肿瘤促进因子。
LUAD血清中LCN2表达情况
血清作为常见的临床检测样本,在临床诊断中起着重要作用。LCN2已被证明是多种癌症患者的生物标志物,如果LUAD在血清中的诊断和预后价值能够得到证明,对LUAD的临床研究具有重要意义。所以,作者对LCN2在血清中的表达情况进行了检验。作者招募了 140 名参与者(98 名 LUAD 患者和 42 名健康对照)进行后续分析。作者首先对上述患者血清LCN2水平进行验证。LUAD患者血清中LCN2水平显著高于健康对照组(如图11A)。随后,作者分析了血清中LCN2水平与LUAD患者临床特征之间的相关性。吸烟者的血清LCN2水平显著高于未吸烟患者。然而,在性别和年龄方面没有观察到显着差异(如图11B-D)。与LUAD的I-II期相比,处于III-IV期的LUAD患者的LCN2水平明显更高(如图11E)。处于T2-T4、N1-N3和M1的患者的LCN2水平分别显著高于T1、N0和M0期(如图11F-H)。除此之外,作者通过Logistic回归分析血清LCN2的影响因素。结果显示III-IV期、淋巴结和远处转移与血清LCN2表达较高相关(如表2)。
血清LCN2对LUAD患者的诊断价值
如表5和图9A所示,LUAD的LCN2曲线下面积(AUC)为0.818,在诊断LUAD的III-IV期时尤其高(AUC=0.895)(如图12A)。此外,LCN2区分了I-II期和III-IV期LUAD患者,AUC为0.795,敏感性为86.67%,特异性为68.18%(如表3和如图12B)。当使用肿瘤标志物(CEA、CA125、CYFR21-1)区分临床分期时,其AUC分别为为0.809/0.832/0.837,敏感性为76.56%/80.95%/66.67%,特异性为81.08%/93.33%/85.71%(表6和图9C)。当将上述肿瘤标志物结合用于诊断LUAD时,LCN2+CEA、LCN2+CA125、LCN2+CYFR21–1和LCN2+CEA+CA125+CYFR21–1的AUC明显更高(如表3 和如图12D)。将肿瘤标志物结合用于诊断LUAD的效果明显高于单独使用。上述结果表明,血清LCN2 被证实为 LUAD 的诊断和预后标志物,在癌症筛查、诊断、治疗评估和预后随访中可能具有临床价值。
研究总结:
在这项研究中,作者通过生物信息学方法对LCN2在肺腺癌中的作用以及可能发生的机制进行了探究,并通过体外实验和临床样本进行了验证。作者发现,LCN2在LUAD中属于肿瘤促进因子。LCN2在LUAD中的表达显著上调,而高水平的LCN2表达与不良预后相关。这表明LCN2可能是LUAD与免疫浸润相关的重要诊断和预后生物标志物。这些发现为发展新型无创LUAD诊断方法提供了坚实的理论基础,但对于进一步研究及其机制尚需深入探索。
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