课程补充—-关于单细胞空间外显子分析的突变空间微环境解析

作者,Evil Genius

我们的单细胞空间外显子分析课程已经开始了,欢迎大家报名,多组学是分析的潮流,也有助于我们深刻的认识生物学问题,甚至于找到解决问题的方法,单一组学都有局限性,一叶障目并不可取。

今天放假,明天中秋节,祝大家中秋节快乐,作为单身狗,最主要的祝大家有情人终成眷属。

大家千万不要跟我一样倒霉,有缘人没有就算了,出去玩也是一个人,逼不得已在家看文献。

今日话题:突变的空间微环境景观

今日参考文章

首先看一下什么是IDH基因,IDH1/2(生物标志物)是与细胞代谢相关的基因,发生突变后参与肿瘤的发生发展。 检测其是否发生突变可以针对性的指导靶向治疗,同时该指标还对急性髓系白血病以及神经胶质瘤有预后提示作用。 IDH1/IDH2生物学作用 IDH1和IDH2分别编码异柠檬酸脱氢酶1和2,可催化异辛酸根氧化脱羧为ɑ-酮戊二酸。 IDH1/2是人类癌症中最常发生突变的代谢基因,干扰细胞代谢和表观调节,促进癌症发生。

其实大家分析各种肿瘤异质性,归根结底是基因突变导致的,单细胞空间转录组在基因表达上的异质性只是表象,而且这个表象很大程度上还是有问题的。

当然了,空间上的分析少不了共定位分析

shows that MES-Ast represents a unique state and not the simple combination of colocalized MES-like and AC-like cancer cells

突变的肿瘤空间样本会凸显不同的微生态,关于微环境的分析一直都是单细胞空间分析的重点,而从空间上看,肿瘤区域有了专门结构化的特点。

空间层面上突变造成的通讯紊乱也是很明显的一点

生活很好,有你更好,简单记录一下,为课程ppt提供素材。

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作者:Mr李
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来源:TechFM
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