朱健康团队WGBS揭示主动DNA去甲基化缺失植物的DNA甲基化跨代增加|PNAS
DNA甲基化是一种在植物和哺乳动物中保守的表观遗传标记,对生长、发育、疾病和寿命具有重要作用。植物和动物基因组中DNA甲基化的主动获得或丢失,以及DNA甲基化水平变化可能导致减数分裂稳定的表观遗传变异,这些变异产生可遗传的表型多样性。尽管对跨代表观遗传已经了解很多,但目前尚不清楚跨代表观遗传稳定性是否可能受到哪些细胞因子的调控。
2024年5月20日,,南方科技大学朱健康院士团队在《PNAS》 (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)杂志上发表题为“Transgenerational increases in DNA methylation in Arabidopsis plants defective in active DNA demethylation”的研究成果,该研究以模式生物拟南芥为研究对象,通过WGBS等分析揭示了DNA去甲基化酶ROS1突变导致基因组水平上DNA甲基化水平逐代升高。研究表明了ROS1在阻止随机形成的DNA甲基化的跨代遗传、维持表观基因组稳定中发挥重要监控功能。本研究对理解基因组DNA甲基化的进化以及生存环境如何通过表观遗传影响后代具有重要意义。
标题:Transgenerational increases in DNA methylation in Arabidopsis plants defective in active DNA demethylation(在主动DNA去甲基化缺陷的拟南芥植物中,DNA甲基化的跨代增加)
杂志:PNAS
影响因子:IF 9.4 /Q1
技术平台:WGBS
研究摘要:
本研究分析了从单粒种子后代连续繁殖10代(G1-G10)的野生型和ros1突变体拟南芥植物在正常和盐胁迫两种生长条件下主动发生的DNA甲基化跨代变化。分析结果揭示了主动DNA去甲基化功能缺失的ros1突变体显示出增加的跨代表观遗传突变率。与野生型相比,ros1突变体在个别胞嘧啶上获得的甲基化比丢失的甲基化要多,而野生型则在主动获得和丢失的甲基化胞嘧啶数量上相似。同样的,跨代表观遗传差异甲基化区域在ros1突变体中也表现出高甲基化。本研究结果揭示了ROS1 DNA去甲基化酶对跨代表观遗传稳定性的遗传贡献,并表明ROS1可能具有防止跨代DNA甲基化增加的意外监控功能。
研究方法:
样本选择:Col-0 野生型和 ros1 突变体,正常和盐胁迫条件下从单粒拟南芥种子连续繁殖10代(G1-G10),每一代创建5个独立株系。通过WGBS分析G1-G10的差异甲基化位点(DMCs)和差异甲基化区域(DMRs)。
结果图形:
参考文献:
TangK, Zhu X, Xie S, Lang Z, Zhu JK. Transgenerational increases in DNA methylationin Arabidopsis plants defective in active DNA demethylation. Proc Natl Acad SciU S A. 2024 May 28;121(22):e2320468121. doi: 10.1073/pnas.2320468121. PubMedPMID: 38768356.
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作者:congcong
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来源:TechFM
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