一步法荧光定量试剂盒的选择标准
实时荧光定量(RT-qPCR)想必大家都不陌生,根据其实验步骤的不同,可以分为“一步法”与“两步法”。目前来说,两步法研究者用的比较多,即是将反转录和PCR扩增分两步进行,首先从RNA模板反转录得到cDNA,得到的cDNA再进行一次或多次不同的PCR反应。这种方法的最大优点是可以保存反转录后的cDNA产物,但对于需要对大量样品进行分析或定量PCR,又或是对防污染要求比较高的研究者来说是不适用的,而一步法RT-qPCR就很好的解决了这类实验难题。
简单来说,一步法荧光定量就是逆转录和定量PCR在一个反应管内一步完成,使逆转录酶与DNA聚合酶在同一管内同样缓冲液条件下完成反应,整体实验操作简便,非常适合于研究生使用。目前,除了像Thermo Fisher此类国际生物试剂品牌,国内的像BIOG也有用下来不错的一步法荧光定量试剂盒,这些试剂普遍具有以下几个特点:
1、操作简单
加样环节少,两步反应都在一个管中完成,这种方法能克隆微量mRNA 而不需构建 cDNA 文库,省略了cDNA与qPCR反应之间体系转换的过程,操作方便快捷,也大大提高了实验的效率,非常适用于高通量扩增/筛选;
2、减少污染
cDNA合成和扩增之间不需要打开反应管盖,更少的移液步骤能够减少污染的风险,同时具有更少的实验误差;
3、灵敏度更高
一步法反转录得到的所有cDNA都用来扩增,所以相比于两步法来说灵敏度更高,可高出10倍,且最低可检测到1 pg总RNA中的目标片段,有些两步法无法检测到的数据,用一步法可以检出。
此外,我们还购买了一款国产品牌的一步法RT-qPCR试剂盒与BIOG的进行了比较,结果如下图所示,从扩增曲线结果来看,BIOG一步染料法荧光定量PCR试剂盒反应更为灵敏,线性范围宽,稳定性好。
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