文献解读-Listeria monocytogenes personalized cancer vaccines drive therapeutic immune responses to ca…

关键词:基因编辑;基因测序;变异检测;


文献简介

标题(英文):Listeria monocytogenes personalized cancer vaccines drive therapeutic immune responses to cancer derived neoantigens

标题(中文):李斯特菌个体化肿瘤疫苗驱动肿瘤新抗原的免疫治疗

发表期刊:bioRxiv

作者单位:Amgen公司

发表年份:2020

文章地址:https://doi.org/10.1101/2020.05.11.088930

图1 文献介绍

癌症免疫治疗领域的最新进展已确定CD8+ T细胞对肿瘤特异性突变的反应是肿瘤消退和总生存的关键驱动因素。ADXS-NEO是一种基于李斯特菌(Lm)的个性化免疫疗法,旨在靶向患者的突变衍生肿瘤特异性新抗原。

该研究通过对MC38小鼠肿瘤细胞系的全外显子组测序鉴定出2870个独特的非同义突变。使用netMHCcons算法预测137种潜在的新抗原。通过肽免疫后进行ELISPOT或检查点抑制剂治疗后识别新抗原肽的CD8+T细胞的存在来验证20种免疫原性新抗原。


测序流程

在配对样本数据分析部分,研究者使用Sentieon软件进行去重复、INDEL重比对、BQSR及使用Sentieon TNseq模块进行somatic突变检测。

图2 Sentieon的作用

图3  Sentieon TNseq的流程图

图4  MC38癌细胞系新抗原的免疫原性筛选

Sentieon软件团队拥有丰富的软件开发及算法优化工程经验,致力于解决生物数据分析中的速度与准确度瓶颈,为来自于分子诊断、药物研发、临床医疗、人群队列、动植物等多个领域的合作伙伴提供高效精准的软件解决方案,共同推动基因技术的发展。截至2023年3月份,Sentieon已经在全球范围内为1300+用户提供服务,被世界一级影响因子刊物如NEJM、Cell、Nature等广泛引用,引用次数超过700篇。此外,Sentieon连续数年摘得了Precision FDA、Dream Challenges等多个权威评比的桂冠,在业内获得广泛认可。


文献讨论

图5 文献讨论

这项研究展示了ADXS-NEO新抗原癌症疫苗在克服癌症免疫治疗两大主要挑战方面的潜力。通过使用临床前小鼠肿瘤模型,研究证实ADXS-NEO能够产生强大的新抗原特异性T细胞反应,并将"冷"肿瘤微环境转变为"热"。作为一种基因工程改造的单核细胞李斯特菌疫苗,ADXS-NEO每个构建可靠定多达40个潜在新抗原,在MC38肿瘤模型中引发强大T细胞反应。系统给药后,它能驱动促炎性先天和适应性免疫,减弱肿瘤内的免疫抑制细胞(如调节性T细胞、髓系来源抑制细胞和M2型肿瘤相关巨噬细胞),同时产生效应αβ/γδ肿瘤浸润T细胞和M1型巨噬细胞。这些结果表明ADXS-NEO是一个有前景的个性化免疫治疗平台,能够同时驱动针对多个新抗原的效应T细胞反应和激活先天免疫细胞,最终产生针对肿瘤衍生新抗原的强大和长效免疫反应。


总结

综上所述,研究表明,ADXS-NEO是一种有效的免疫疗法,能够驱动针对肿瘤特异性突变的免疫反应,并导致小鼠肿瘤得到控制。

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作者:dingding
链接:https://www.techfm.club/p/160611.html
来源:TechFM
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