合适的内参选择,精准的荧光PCR定量
一、实时荧光定量PCR定义
实时荧光定量PCR(Quantitative Real-timePCR,qPCR)是一种在PCR扩增反应体系中加入荧光基团,对扩增反应中每一个循环产物荧光信号的实时检测,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。
二、荧光定量PCR工作原理
1.荧光探针法
在PCR过程中加入一对引物得同时加入一个特异性荧光探针,探针两端分别标记一个报告荧光基团和一个猝灭荧光基团。当报告荧光基团和猝灭荧光基团链接在一条链上时,报告荧光基团发射的荧光信号被猝灭基团吸收,因此检测不到荧光信号。当PCR扩增时,Taq酶将探针酶切分解,报告荧光基团与猝灭基团分离,产生可以被检测得荧光信号,且荧光信号的强度与扩增的DNA链数量成正比。
2.荧光染料法
目前最常用的荧光染料是SYBR Green I,是一种具有绿色激发波长的燃料。游离状态下SYBR Green I的荧光非常微弱,在与双链DNA结合后,荧光大大增强。荧光信号强度与双链形成数量成正比,因此可以用于PCR合成双链数量的定量检测。
三、内参基因选择
内参基因,也成为“管家基因”、“持家基因”,因其在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测基因表达水平变化时被用作参照物,所以被叫做内参基因。
内参基因可以用于矫正由于上样量、上样过程中存在的误差。理想的内参基因的选择可以有效提高荧光定量PCR的灵敏度和重复性。理想的内参基因应在研究的各种试验因素条件下均恒定表达。然而大量研究表明,任何一种内参基因都不能在所有试验条件下恒定表达,因此在进行定量分析前,应进行内参基因的验证,选定一种较为稳定的理想内参基因。
常见的内参基因包括GAPDH、β-actin、18sRNA、B2M、HPRT和TBP等。
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