如何迅速了解有机物晶体信息？

有机化合物的晶体结构在许多领域中具有广泛的应用，对于从事科研工作、药物晶型研究、光电子学及相关领域的人士来说，了解化合物的晶体信息是非常必要的。通过深入理解晶体结构与药物性质之间的关系，可以优化药物设计、提高药物质量、确保疗效和安全性；也能帮助科学家理解催化反应的机理以及反应中可能发生的分子间相互作用。

如何快速查看有机物晶体信息？如何查看有机物晶胞参数？如何知晓晶体信息来源哪里？如何一键保存下载晶体3D结构图？不知道大家是否遇到过这些问题。为此笔者科普一个有机物晶体信息查询的数据库，非常简单，仅需3步。

查询步骤：

①进入摩熵化学

②在首页输入目标有机物，进行检索

③列表页点击物质名称，进入详情页，查看晶体信息

此外也可通过‘查晶体’模块，自定义填写内容，一键检索目标有机物。如下图：

图源：摩熵化学

适用人群

材料科学家：

通过分析晶体结构，可帮助科学家和工程师了解材料的微观结构，预测其宏观性能，使之可以设计出具有特定性质的新材料，比如高强度、高导电性或特定催化性能的材料。

生物学家和药物研发人员：

在药物设计中，研究人员了解药物分子与生物靶标（如蛋白质）的晶体结构有助于优化药物的结合亲和力和选择性，可以为药物的研发和优化提供指导，有助于开发新疗法。

化学和生物学研究人员：

晶体的3D结构揭示了原子、分子或离子在晶体中的排列方式。在合成化学和催化化学领域，化学家需要了解分子在晶体中的排列，以优化合成路径和提高催化剂的效率。

地质学家和矿物学家：

研究矿物和岩石的晶体结构，以分类矿物、探索矿产资源和理解地球内部过程。

摩熵化学晶体数据库的核心优势

摩熵化学晶体数据库收录有机物晶体结构信息，专注于有机化学领域的数据构建。该数据库目前包含超过100万条有机物晶体信息，提供详尽的晶胞参数内容，包括晶胞轴角、棱长、空间群、熔点、R值等。信息均源于真实文献数据，可便捷查看参考文献与Doi。目前数据库已实现自动化更新，提供多种检索方式，以支持有机化学、材料化学、生物医药等领域用户快速获取晶体信息。

1.晶体信息查询方式：

摩熵化学晶体数据库为满足有机化学领域的研究需求，精心打造了化学有机物晶体信息模块，数据库提供了多种搜索选项，包括快速搜索、字段搜索（“查晶体”模块）和结构式搜索。全面覆盖了晶体信息的各个方面，包括化学式、分子量、CAS、空间群、空间群符号、晶胞体积、晶胞轴角、晶胞棱长、参考文献、DOI等。可以根据自己的需求进行精确搜索，从而提高搜索的准确性和效率。

（1）一键检索

在数据库的主页面搜索栏中，用户只需输入搜索关键词即可执行快速检索。这些关键词涵盖化合物名称、CAS、InChi、inChiKey、MDL、EINECS、Beilstein等。

（2）字段检索（“查晶体”模块）

字段搜索其实就是在“查晶体”此模块进行的。在字段搜索中，可以根据化学式、DOI、空间群、晶胞体积等10种不同的字段进行灵活组合搜索，从而提高搜索的准确性和效率。目前至少填写1项内容。

（3）结构式检索

在使用结构式搜索功能时，需在结构编辑器上绘制结构式。目前，已知化合物数量早已突破亿级，其中较为复杂的化合物的占比越来越多，它们标准的系统名称自然就更复杂。这种情况下通过化合物名称检索并不方便。在面对复杂化合物，我们可以采取绘制结构进行查询，检索模式分为精确检索、子结构、相似性检索。并且结构式检索功能可以利用化学标识符来导入结构，也可直接选择预设模板、常用基团和溶剂快速绘制。

2.晶体信息检索结果页面介绍

不同的检索方式其检索的结果会有所差别，但实质信息是不变的。在摩熵化学晶体数据库的一键搜索结果界面中，包含了有机物晶体信息内容：晶胞轴角、晶胞棱长（轴长）、空间群、晶胞体积、R值、熔点、环境衍射温度、DOI、参考文献。检索的信息丰富，可在下方进行切换查看。支持收藏，支持导出（物质信息），方便研究人员后续的查看。支持查看3D结构图。

在字段检索（“查晶体”模块）结果界面中，包含范围相关的物质，含物质的名称、结构式、化学式、分子量、CAS、空间群、空间群符号、晶胞体积、晶胞轴角、参考文献、DOI等信息。并且页面左侧提供了筛选栏，可以自定义选择内容，如：分子量、是否含DOI、空间群、期刊等，减少无关信息的干扰。在上方可点击下拉按钮进行内容的更改或者一键重置。也可以切换列表页展示样式。

在结构式检索结果页面中，检索的内容还可以进行二次筛选，如：分子量、试验性质（熔点、沸点、密度等）、计算性质（辛醇/水分配系数、重原子数等）特征基团（官能团、杂环）。此步骤检索出来的晶体信息内容与一键检索结果一致。

3.晶体3D结构内容详情与其他功能

摩熵化学提供化合物的晶体3D模型，全方位展示。支持查看晶体的3D结构，可任意拖动、调节结构大小，旋转结构式。支持自定义调整需求，右击鼠标，可根据已有选项自行选择视图、样式、颜色、表面、对称性、缩放、旋转、振动、光谱等功能。也可进行选择，设置结构，如显示选择光圈、蛋白质元素、碳水化合物等内容。丰富的筛选项满足多重展现需求。

支持分子3D 结构的保存与下载。保存有几种样式的选择，如：保存脚本及状态、全部保存为Jmol文件、保存为JvXL等值面等样式。 导出支持GIF、JPG、PNG、PNG+JMOL、POV-Ray图像，也支持导出VRML 3D、X3D 3D、STL 3D模型。