单细胞转录组-生物标志物篇 | 从异质性描绘到筛查应用

宫颈癌（Cervical cancer, CC）是一种常见的妇科恶性肿瘤。尽管目前的筛查方法已被证明有效并显著降低了CC的发病率和死亡率，但仍然存在缺陷。单细胞RNA测序可以在单细胞分辨率下鉴定复杂和稀有的细胞群。通过scRNA-seq，已经绘制和描述了肿瘤微环境在宫颈癌发生中的异质性。但目前尚不清楚这些变化是否可以检测到并应用于CC筛查。

研究思路

研究结论

在本研究中，作者对来自15个样本的 56,173个宫颈剥落细胞进行了scRNA-seq，包括正常宫颈、低级别鳞状上皮内病变Low-grade Squamous Intraepithelial Lesion, LSIL）、高级别鳞状上皮内病变（Low-grade Squamous Intraepithelial Lesion, HSIL）和恶性肿瘤。描绘了宫颈病变进展过程中免疫和上皮细胞的改变，脂质相关巨噬细胞的一个子集 被鉴定为肿瘤促成元件，可以作为预测LSIL进展为HSIL的生物标志物，后续通过免疫荧光进行验证。此外，细胞间通讯分析表明，SPP1-CD44轴可能在上皮细胞和巨噬细胞 之间表现出促肿瘤相互作用。通过研究宫颈癌发生中的宫颈多细胞生态系统，确定了早期检测的潜在生物标志物。

单细胞结果展示

CNV分析

T细胞Marker基因气泡图

细胞间通讯分析