【Rna-seq 分析流程】11. GeneMANIA和分子调控网络

1. 简介

推测关键基因的作用和调控机制，

• 可以通过关键基因与其功能相似基因之间的相互作用和功能，进行类比；
• 通过研究关键基因mRNA，miRNA和 lncRNA之间的关系获得调控机制。

2. 数据信息

关键基因的基因名

3. 思路

1. GeneMANIA 输入关键基因，构建关键基因-其他相似基因之间相互作用的网络，以此识别和鉴定这些关键基因的功能。
2. TargetScan 和 miRMap数据库分别预测 mRNA 的 miRNA，取交集获得 miRNA；
   基于关键miRNA，starbase 和 mirnet 预测与miRNA可能互作的 lncRNA，取交集获得 lncRNA。

5. 结果展示

genemania-network.jpg

mRNA-miRNA-lncRNA.png