【Rna-seq 分析流程】10. RNA甲基化修饰

dingding • • 杂文

1. 简介

研究RNA甲基化修饰与AAV之间的内在联系，有助于揭示AAV的发病机制，为开发新的诊断标志物和治疗靶点提供理论依据，从而为精准治疗开辟新路径。

2. 数据信息

关键基因的基因名

3. 思路

  1. SPAMP 在关键基因的mRNA序列中预测关键基因的 m6A 修饰位点及其在 RNA 二级结构中的位置
  2. ENCORI 和 RBPsuite 鉴定可与关键基因相互作用的m6A修饰蛋白，并通过 R 包取 ENCORI 和 RBPsuite 的交集

5. 结果展示

CD74_vh_397.png

CD74_vh_691.png

CD74-SPAMP.jpg

HNRNPA2B1.png

HNRNPA2B1_NM_0010251593 Homo sapiens CD74 molecule (CD74) transcript variant 1 mRNA.jpg

VCAN-SPAMP.jpg

YTHDC1.png

YTHDC1_NM_0011640972 Homo sapiens versican (VCAN) transcript variant 3 mRNA.jpg

venn_ENCORI_RBP_VCAN.png

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作者：dingding
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