【Rna-seq 分析流程】12. 药物预测与分子对接

1. 简介

预测与AAV相关的潜在药物，并探究AAV发病过程中的关键基因与潜在药物之间的相互关系。

2. 数据信息

关键基因基因名

3. 思路

1. [DGIdb数据库](https://www.dgidb.org/search interactions)预测关键基因与AAV相关的潜在药物，并使用 Cytoscape 软件将关键基因-药物的相互作用网络图进行可视化处理
2. 基于得的药物，使用IBDB数据库 来检索关键基因潜在靶蛋白的3D构型。使用 PyMOL 程序消除水和溶剂分子，使用 AutoDockTool 软件将它们保存为IBDBQT格式。利用Autodock tools和Autodock Vina进行分子对接，记录结合能。

5. 结果展示

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