Xena – TCGA数据下载

1，Xena官网
浏览器中输入网址 http://xena.ucsc.edu/ ，下拉找到Explore TCGA, GDC, and other public cancer genomics resources，点击

2，选择数据集
下拉选择需要的队列，此处以BRCA为例

3.查看数据
点击 GDC TCGA Breast Cancer (BRCA) ，进入BRCA数据集，查看有哪些数据

4.下载所需数据
选择对应的文件链接，点击即可。此处以点击 HTSeq - Counts 为例

注意
此数据为count数是log转化后的，需要的时候可以自行转为count数。
记得下载probeMap，探针注释文件。
涉及预后及生存相关分析，记得下载 survival data 。