参考基因组的下载

下载参考基因组的网站/方法

Ensembl：https://ftp.ensembl.org/pub/
Ensemblgenome：http://ftp.ensemblgenomes.org/pub/
NCBI:https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/
UCSC:ftp://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath
JGI:
论文中提供的地址：论文中也会提供数据的储存位置，找到对应的储存网站即可

需要下载的数据

基因组序列(genome.fasta)
基因注释(genes.gtf)
蛋白序列(proteins.fasta)

下载步骤

1.以Ensembl中人(homo_sapiens)的数据为例
打开ftp网址找到最新版本的release版本(release_xxx)fasta/homo_sapiensdna/*.primary_assembly版本服务器wget命令下载返回release_xxxgtf/homo_sapiens/.chr.gtf.gz/.gtf.gz服务器wget命令下载