Meta分析软件盘点,做Meta要用哪些软件?含meta分析软件安装包!
书接上回,之前我们在《meta分析的基本步骤是什么?附实例讲解,7步快速见刊策略》文章里详细给大家介绍了撰写一篇Meta分析需要经过哪些步骤。
今天我们就从这些步骤入手,给大家盘点盘点写一篇Meta分析具体需要用到哪些meta分析软件?
一、选题和检索
选题和检索基本不需要涉及到什么Meta分析软件,通过一些数据库即可完成。
常用的英文文献检索平台有:Pubmed、Embase、Cochrane Library、web of science、ClinicalTrials.gov等等。
中文文献检索平台有:知网、万方、SinoMed、VIP等等。
二、文献筛选
文献筛选这个环节主要用到的Meta分析软件就是我们日常使用的文献管理软件,Endnote、NoteExpress、Zotero等等之类的。
文献筛选,顾名思义就是要从我们检索到的所有文献中,按照预先制定好的纳入排除标准筛选出符合我们要求的纳入文献。
所以这个筛选过程,其实说简单点就是利用文献管理软件的分组管理功能,将所有检索到的文献按照纳排标准进行分类,最终按照每一个分组中的文献数量绘制文献筛选流程图就可以了。
分组管理功能是每个文献管理软件的基础功能,无论你选择哪款软件,都没有什么太大的影响,更重要的是要有一个规范化的筛选思路和流程。
这里我以Endnote文献管理软件为例,导入检索好的所有文献之后,可以使用软件自带的筛选重复文献:
然后利用批量检索功能,快速删除case report和综述之类的文献:
在阅读过程中,会发现一些不相关的文献,也可以利用批量检索的方法,快速定位到这些文献,然后删除。当然,这里不是指真的要将文献放到回收站,而是要根据每一次删除的操作,新建一个分组,将对应的文献放到组里,这样删除原因和删除的文献数量就都保留下来了,避免了误删。
剩下的复筛也是类似,通过阅读摘要和全文,将文献分组归纳。最终确认纳入我们研究的原始文献。
三、数据提取
数据提取需要用到的Meta分析软件,一般就是excel表格啦。
需要提取的信息有3类:证据质量的信息、证据的基本信息和结局指标数据。根据PICOS原则设计好基本信息汇总表后,从每一篇原始文献中提取数据填入即可。
这里给大家分享一个我私藏的Meta分析软件——贴心小工具:
StatsTodo。这个网站是一个在线的数据提取工具,可以对多组均值标准差进行合并的一个处理。打开网页,输入数据,就可以基于Cochrane公式一键进行合成,生成合并后的数据,非常方便,建议大家自己试试。
四、统计分析出图
前几步完成后,就进入最核心的数据分析环节了。
其实Meta分析的数据处理就像用洗衣机一样简单,只要前述步骤按照规范操作,到了处理这里只需要将Excel里提取的数据扔到Meta分析软件里,Meta分析软件就会自动出结果了。
可以做数据分析的meta分析软件有很多,像R语言、RevMan、Stata都是比较常用的软件。
4.1 Meta分析软件RevMan
RevMan是Cochrane协作网系统评价的标准化专用软件,具备meta分析的大部分功能,面板式操作,鼠标点击即可完成,操作非常简单,适合新手。但是RevMan也有一个很明显的Bug就是,它不能做偏倚回归图,所以建议没有编程基础的小白如果选择RevMan的话一定要结合其他软件一起使用。
软件基本页面展示:
详细的软件使用教程,后续我会给大家出专门的系列文章讲解。
4.2 Meta分析软件 R语言
R语言,也是Meta分析软件中非常常用的一款软件,基于其开源的特点,在R语言中只需要引入meta程序包就可以开始使用了。
不过R语言是一款程序语言,所以对于新手来说,可能使用上有一定难度。
用R语言做Meta分析,不仅可以拥有强大的数据分析功能,还能获得无可比拟的灵活绘图体验。虽然要基于代码进行操作,但是所有代码函数基本上都是现成的,导入数据,简单修改参数即可完成!
R语言的安装:
在首页找到蓝色的【download R】:
因为是国外的软件,所以下载只能通过镜像。进入镜像源选择页面后,找到中国的资源链接,随便选择一个离自己近一点的镜像:
最后根据自己的电脑系统版本,下载安装包即可:
安装的过程很简单,全程【next】就可以了。需要提醒一点,安装路径最好选择一个全英文的路径,最好直接安装在C盘,这样可以避免后续很多不必要的报错。
4.3 Meta分析软件 STATA
相较于前两款,STATA更像一把瑞士军刀,体积虽小,功能却是异常强大,也是目前Meta分析软件中最受推崇的软件,它能够完成几乎所有的Meta分析的统计计算部分。
Stata可以汇总二分类变量、连续型变量、诊断试验、单纯P值、剂量反应、生存资料、Meta回归、累计Meta、网状Meta等等。
还可以做森林图、漏斗图、拉贝图、Galbraith等等,你能想到的它基本都可以做到。
不过STATA的使用也需要命令操作,所以对于新手来说也有一定的难度。
解压压缩包后,以管理员身份运行安装包内的 SetupStata16.exe
全程点下一步直接安装即可。
和R语言一样,在选择安装路径的时候,不要让路径里存在中文字符,如果你电脑是用自己名字命名的,默认的C盘安装路径里可能会有你的名字,存在中文字符,这样就是不行的。
可以换一个盘,比如D盘,在D盘里新建一个文件夹命名为stata,然后把安装路径选择到新建的这个文件夹里。这样安装路径就是D:/stata,这个路径就是纯英文的,就可以了。然后等待安装就可以了。
安装完成后,打开软件输入激活码就可以用了~
五、结语
三款软件各有优劣,大家根据自己的习惯选择一两款进行综合使用即可。
meta分析软件毕竟只是工具,无论是选择哪款软件进行Meta分析研究,最终落脚点还是要归于自己是否真的掌握了系统的meta分析流程,以及每一个环节是否真的按标准进行操作。
巧妇难为无米之炊,没有文献没有数据,只懂得如何用软件,也是做不出一篇好的文章的。
所以如果你真的想在今年发表一篇Meta分析的文章的话,小编还是建议大家,可以根据自己的计划,安排系统的meta分析学习,避免因为不规范的学习耽误研究进度。
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