重磅！热门单细胞大数据深度分析利器——OmniBrowser™ v3.2版本更新

近年来，随着单细胞测序技术在免疫、干细胞分化、肿瘤异质性、神经系统发育等多个研究领域取得惊人进展，追踪药物处理前后病变组织的细胞组成、状态和谱系的变化、通过对比响应和非响应患者的细胞类群研究个体耐药性的差异成为可能。由此看来，单细胞大数据的分析和挖掘，对于新的疾病靶点和生物标记物的发现、靶向药物的开发与应用、实现精准医疗有着十分重大的意义。百奥智汇软件团队针对科研人员和药企研发团队对日益增长的单细胞大数据分析和挖掘需求，基于世界规模领先的单细胞多组学数据库Omni Single Cell Database，开发了单细胞多组学大数据深度挖掘&分析平台——OmniBrowser™。我们已于2022年9月26日推出新版本OmniBrowser™ v3.2，该版本是该平台自2021年发布v3.0及v3.1之后的重大更新，致力于为更多用户提供可靠、精确、高效的公共数据挖掘与呈现。本次新增的亮点功能如下：治疗信息、正常细胞图谱主题页面；多基因搜索功能与丰富参考信息；细胞质控信息&TCR分布；细节功能打磨优化。

治疗信息一键概览：肿瘤治疗信息主题页 

单细胞数据正在呈指数级涌现，不同研究作者对细胞类型的注释和分析的信息浩如烟海，阅读梳理和分析比对需要大量的时间和精力。百奥智汇研发团队针对肿瘤治疗前后样本细胞比例的变化等热门问题，新增Treatment（治疗信息）主题页面，对数据库中所有与肿瘤治疗相关的数据集进行了汇总和人工注释，将治疗种类归纳为单抗药物、小分子抑制剂等七个大类，呈现治疗对象、组织和文库制备方法汇总，使用户可以概览特定治疗方法的领域进展，还能根据疾病和治疗信息快速筛选感兴趣的数据集；此外，数据团队梳理了单个数据集使用的实验样本、文库制备方法和治疗类型，使数据集内容一目了然；并在常规搜索页面添加Treatment筛选条件，一键可得关注研究列表，清晰高效。

图1. Treatment主题页数据统计图

组织细胞图谱展现：正常细胞图谱主题页

要研究细胞在疾病状态下的基因差异表达，高质量的正常细胞对照数据十分重要。OmniBrowser™新增正常细胞图谱主题页，展示数据库中收录的正常组织的单细胞测序研究。正常细胞数据涵盖人源70个组织，小鼠源50个组织，并以饼图展示多组织研究中各组织细胞比例，以直方图展示研究中的细胞类型与数目。多组织细胞图谱研究支持比较分析功能，用户可以通过热图查看多组织细胞图谱中包含的各组织，还可以选择感兴趣的组织，以柱形图形式查看其在不同研究中各细胞类型的数目，大数据分析尽在掌握。

图2. Normal Cell Atlas主题页多组织细胞类群分布图

基因分析更加强大：多基因搜索与更多参考

基因的表达分析是细胞调控机理的揭示和药物刺激的疗效研究中的关键步骤。OmniBrowser™新增多基因搜索功能，支持设置基因表达量范围，使用户可在数据库中定量组合搜索多个目标基因，搜索结果以箱线图或气泡图展示。除数据集列表外，总结模块以气泡图呈现筛选到的数据集中各基因的表达量与在细胞类群中的表达比例，样本量更多，结论更可靠。此外，OmniBrowser™嵌入互作基因、同源基因图谱，基因产物列表和ACMG建议的致病相关基因图谱，用户可一键解锁更多参考，更加强大易用。

图3. 多基因搜索结果气泡图

细胞层级信息呈现：细胞质控信息&TCR

单细胞转录组测序得到的细胞基因的高维数据，需要通过质控，主成分分析（PCA），降维和聚类来呈现降维图并完成下游基因和功能分析。OmniBrowser™在降维视图新增细胞质控信息模式，TCR视图中添加按照选择类群计算克隆扩增数目选项，一图呈现多组学数据，强大功能助力用户在单细胞精度上的研究探索。

图4. 单细胞水平的TCR克隆扩增分布图

用户体验定制开发：细节功能打磨优化

除了以上几大新增功能外，OmniBrowser™研发团队深入调研用户使用体验，想用户所想，打磨功能细节，致力于提升用户的使用体验，如增加Disease Ontology层级搜索，Marker Genes自选组间的标记基因计算，基因集分析页面支持文本编辑和多种分隔符的基因输入，批量保存截图时按数据集分文件夹保存等。