Clusterprofile多分组富集分析及可视化

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R语言clusterProfiler包GO富集分析（enrichplot包、GOplot包和ggplot2绘图） - 简书 (jianshu.com)

eG <- enrichGO(gene = g_list, #需要分析的基因的EntrezID
               OrgDb = org.Hs.eg.db, #人基因数据库
               pvalueCutoff =0.01, #设置pvalue界值
               qvalueCutoff = 0.01, #设置qvalue界值(FDR校正后的p值）
               ont="all", #选择功能富集的类型，可选BP、MF、CC，这里选择all。
               readable =T)

富集分析的类型可选BP（biological process）、MF（molecular function）、CC（Cellular Component）。

Q&A | 如何使用clusterProfiler对MSigDB数据库进行富集分析 - 简书 (jianshu.com)